酶解法成为应用最广泛、最成熟的制备工艺。酶解法主要是利用各种蛋白酶将核桃蛋白水解产生多肽，常用的酶主要有中性蛋白酶、碱性蛋白酶、风味蛋白酶、木瓜蛋白酶、胰酶。通过酶解得到小分子的肽类物质。然后，通过过滤、浓缩、干燥等步骤，得到最终的核桃肽产品，使其更容易被人体吸收和利用。